什么是新型冠狀病毒 新型冠狀病毒(2019-nCoV)是冠狀病毒,由RNA核酸和蛋白等組成,RNA很容易降解,蛋白衣殼將RNA包裹在其中,加上一層由脂質(zhì)和糖蛋白組成的包膜外衣,從而使其RNA得到保護(hù)。病毒通過特定細(xì)胞表面的受體入侵細(xì)胞造成感染,并且利用宿主細(xì)胞進(jìn)行復(fù)制增殖。冠狀病毒亞科分為α、β、γ和δ四個(gè)屬,新型冠狀病毒屬于β屬。新型冠狀病毒與中東呼吸綜合征相關(guān)冠狀病毒MERSr-Cov、嚴(yán)重急性呼吸綜合征相關(guān)冠狀病毒SARSr-Cov一樣,都會(huì)引起上呼吸道感染,可引起肺炎、甚至重癥肺炎,且可人傳人。 圖片來源:美國衛(wèi)生研究院(NIH)官網(wǎng) 中國科學(xué)院武漢病毒研究所石正麗團(tuán)隊(duì)從早期的5位患者樣本中獲得了該病毒的全基因組序列。從支氣管肺泡灌洗液(BALF)中收集五個(gè)重癥患者的樣本(WIV04),采用測序NGS的宏基因組學(xué)分析方法,在1038758個(gè)總讀長或人類基因組篩選獲得的1582個(gè)總讀長中,有1378個(gè)(87.1%)序列與SARSr-CoV匹配(圖2a)。該病毒基因組由冠狀病毒常見的6個(gè)主要開放閱讀框(ORFs)和一些其他輔助基因組成(圖2b)。 圖2來源:Peng Zhou,Zheng-Li Shi,et al. 新型冠狀病毒檢測的方法和原理是什么? 目前新型冠狀病毒的常規(guī)檢測方法為核酸檢測:實(shí)時(shí)熒光定量PCR (Quantitative Real-time PCR)方法。其檢測原理為:一條RNA鏈逆轉(zhuǎn)錄成為互補(bǔ)DNA,再以此為模板通過PCR進(jìn)行DNA片段擴(kuò)增,再通過熒光探測來標(biāo)定擴(kuò)增的DNA片段是否存在。該方法能夠檢測細(xì)胞中的RNA病毒的含量。我國國家衛(wèi)健委提出的針對新型冠狀病毒的檢測標(biāo)準(zhǔn),需要對病毒的多個(gè)保守目標(biāo)序列上的兩個(gè)目標(biāo)靶點(diǎn)(ORFlab、N)均進(jìn)行擴(kuò)增檢測,只有當(dāng)兩個(gè)都顯示陽性了,才能確診。 病毒是否發(fā)生變異? 根據(jù)專家介紹,從現(xiàn)在的情況看,根據(jù)收集到的病毒樣本都是相同的,并沒有出現(xiàn)變異的情況。 檢測方法是否正確? 從原理上來看,RT-qPCR是能夠直接快速從人體中找出是否存在新冠狀病毒RNA序列。我國在檢測過程中選用的是多個(gè)保守目標(biāo)序列,即不容易發(fā)生變異的學(xué)歷片段上的靶點(diǎn)。 為何容易會(huì)出現(xiàn)“假陰性”? 核酸檢測方法的最大特點(diǎn)是特異性高、靈敏度高,但最大的弱點(diǎn)是易受污染影響。樣本采集的時(shí)間,方法以及處理均會(huì)對檢測結(jié)果有影響。 根據(jù)中國國家衛(wèi)健委頒布的《新型冠狀病毒實(shí)驗(yàn)室檢測技術(shù)指南》,采集標(biāo)本的種類里有上呼吸道標(biāo)本(咽拭子、鼻拭子、鼻咽抽取物),下呼吸道標(biāo)本(深咳痰液、呼吸道抽取物、支氣管灌洗液、肺泡灌洗液、肺組織活檢標(biāo)本),血液標(biāo)本,血清標(biāo)本,后來又增加了糞便、肛拭子。而在實(shí)際操作中,采取最多的是咽拭子、鼻拭子之類的上呼吸道標(biāo)本。一些特定的疑似感染的患者,不同的病期,在不同的身體部位出現(xiàn)病毒的濃度會(huì)有差異,如咽部沒有,但可能糞便中有。因此會(huì)出現(xiàn)“假陰性”的結(jié)果。 采集時(shí)讓患者張大嘴后用特制棉簽或小刷頭刮取其咽部采集帶病毒標(biāo)本。如果平時(shí)醫(yī)護(hù)人員咽拭子取樣不多,刮取標(biāo)本時(shí)患者的反應(yīng)又比較大,往往導(dǎo)致刮取標(biāo)本的位置不對,或力度和時(shí)間不夠,沒有刮取到帶病毒的標(biāo)本或刮取到的帶病毒標(biāo)本量少,最后導(dǎo)致檢測結(jié)果陰性。 一旦在實(shí)現(xiàn)過程中操作不當(dāng),出現(xiàn)污染,如RNA酶污染,則會(huì)直接影響檢測結(jié)果。此外對樣本的處理保存也有嚴(yán)格的標(biāo)準(zhǔn)。2019-nCoV為RNA病毒,很容易被外源性或細(xì)胞破壞后所釋放的RNA酶降解,而影響最后的檢測效率。建議標(biāo)本采集后及時(shí)送檢,及時(shí)檢測(4小時(shí))。如因某些原因標(biāo)本采集后不能及時(shí)送檢或及時(shí)檢測,應(yīng)將其置保存:4℃,<24小時(shí); -70℃以下,≥24小時(shí);并且避免反復(fù)凍融。 還有一種可能性,檢測本身是準(zhǔn)確的,只是這些患者在做前幾次檢測的時(shí)候還沒有感染。然而,隨著時(shí)間進(jìn)程,他們后來被感染了,最終檢測結(jié)果呈陽性,確診。 對于新冠病毒的核酸檢測,無論是在規(guī)范樣本采集還是提高試劑檢測靈敏度等等方面,都是需要完善的。核酸檢測仍是當(dāng)前最準(zhǔn)確和靈敏的新冠病毒檢測方法。專家指出,對高度懷疑的有流行病學(xué)史的病例,還是要多次采樣,此外還應(yīng)該根據(jù)病人在臨床上的癥狀、體征等情況以及CT影像等其他檢測結(jié)果來綜合判斷。 總之,病毒沒有出現(xiàn)變異,疑似患者首先要做的仍舊是及時(shí)隔離,接受檢查。面對疫情,我們自身要做好防護(hù)工作,勤洗手,多通風(fēng),出門戴口罩,不信謠,不傳謠!沒有一個(gè)冬天不會(huì)逾越,沒有一個(gè)春天不會(huì)到來,中國加油! 參考文獻(xiàn): [1]Zhou P,Zhou P, Yang XL, et al.Wang XGPneumoniaoutbreak is associated with a novel coronavirus of likely bat origin.Nature.2020 Feb 3. doi: 10.1038/s41586-020-2012-7. [2]國家衛(wèi)健委