從零基礎(chǔ)到玩轉(zhuǎn)，網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)3分左右的文章方法指南學(xué)起來！
傳統(tǒng)中藥歷史悠久，在治療復(fù)雜慢性疾病方面具有獨到的療效和較小的毒副作用。但中藥存在成分復(fù)雜、機(jī)制不清的問題，阻礙了中藥的現(xiàn)代化和國際化。中藥的物質(zhì)基礎(chǔ)和作用機(jī)理，尚需應(yīng)用現(xiàn)代醫(yī)學(xué)和生物科學(xué)技術(shù)，進(jìn)行深入的研究。近年來，將系統(tǒng)生物學(xué)的思想和方法應(yīng)用于中藥研究中，正成為一種新的趨勢。中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)已發(fā)展成為一個新的交叉學(xué)科，它將網(wǎng)絡(luò)科學(xué)、生物信息學(xué)、計算機(jī)科學(xué)和數(shù)學(xué)等學(xué)科的方法結(jié)合到中藥藥理的研究中，從分子水平和分子網(wǎng)絡(luò)調(diào)控的背景中闡明中藥的作用機(jī)理。通過中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的方法，可望使中藥的理論研究和臨床應(yīng)用更加科學(xué)嚴(yán)謹(jǐn)，逐漸得到世界的認(rèn)可。
中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)已成為近年來研究的熱點和國家自然基金重點支持的領(lǐng)域，一系列的數(shù)據(jù)庫及計算方法被開發(fā)出來。但是，對于臨床醫(yī)生、科研人員和碩博士研究生，尤其是沒有生物信息學(xué)分析基礎(chǔ)、不會編寫計算機(jī)程序的初學(xué)者而言，如何合理地應(yīng)用這些已有的數(shù)據(jù)庫和計算方法，分析自己所研究的中藥方劑，解釋實驗結(jié)果，仍然是一大難題。本期課程正是為解決此難點而推出：
課程特色
導(dǎo)師長期從事中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的資深教授，結(jié)合個人實踐經(jīng)驗，帶領(lǐng)廣大學(xué)員，從科研設(shè)計、項目具體實施以及SCI文章發(fā)表等多個方面，通過實際案例，介紹中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的研究思路及具體方法，介紹網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)相關(guān)基金申請及課題設(shè)計，本課程可以提供電子版的ppt，會組建微信群，并把主講教授邀請到微信群解答學(xué)員的疑問。
本次課程以SCI文章為案例主線，逐一詳細(xì)剖析，全程電腦實戰(zhàn)教學(xué)。理論與實踐相結(jié)合，老師將以最簡單易懂的方式，既介紹中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的研究路線、發(fā)展?fàn)顩r和最新前沿進(jìn)展，又介紹具體的數(shù)據(jù)庫、工具和軟件的使用，并在課堂上進(jìn)行上機(jī)指導(dǎo)。本學(xué)習(xí)班全部采用免費數(shù)據(jù)庫和在線分析工具，學(xué)員不需要編寫程序。帶領(lǐng)大家一步一步完成一篇3分SCI論文的全部分析。
導(dǎo)師資質(zhì)
生信博士畢業(yè)，從事生物信息學(xué)及中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方面的研究10多年, 是國內(nèi)最早從事網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究的資深研究人員，發(fā)表生物信息學(xué)、網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)及中藥復(fù)方相關(guān)SCI數(shù)十篇，含多篇5分以上的文章，主持多項國家自然基金和省部級科研課題，獲得多項省部級科研及教學(xué)獎項。講課效果好，獲得學(xué)員廣泛好評。
課程適宜群體
各級醫(yī)院臨床醫(yī)生、藥師、科研單位研究人員、高校老師、碩/博士研究生、企業(yè)相關(guān)研發(fā)人員和對網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和生物信息學(xué)感興趣的廣大同行。同樣適合準(zhǔn)備申請國自然、省自然基金，希望能夠使用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和生物信息學(xué)的分析手段充實基金前期研究基礎(chǔ)，提升基金邏輯性和故事性的老師和同學(xué)。（尤其適合初學(xué)者和無基礎(chǔ)的學(xué)員，無需學(xué)習(xí)任何R語言，輕松解析中藥復(fù)方/單體的作用機(jī)制，講好故事，寫好基金，做好課題，發(fā)好文章）
課程安排
中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)內(nèi)容大綱 | |||
日期 | 時間 | 題目 | 課程內(nèi)容 |
第一天上午 | 9:00-10:45 | 中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)簡介 | 網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的發(fā)展歷程和研究現(xiàn)狀簡介 |
中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)SCI論文的詳細(xì)剖析 | |||
10:30-10:45 | 茶歇 | ||
10:45-12:00 | 中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)簡介 | 中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的核心問題 | |
中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的研究路線 | |||
12:00-13:30 | 午餐及午休 | ||
第一天下午 | 13:30-14:00 | 中藥有效成分的查找 | 常用中藥數(shù)據(jù)庫及使用方法 |
14:00-15:30 | 中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究的數(shù)據(jù)來源 | 化合物結(jié)構(gòu)信息、靶點、ADME信息查詢 | |
用中藥數(shù)據(jù)庫查詢中藥的成分、靶點 | |||
用藥靶數(shù)據(jù)庫查詢化合物靶點 | |||
用化合物結(jié)構(gòu)相似性預(yù)測化合物靶點 | |||
基于藥效團(tuán)模型預(yù)測化合物靶點 | |||
用分子對接驗證化合物靶點 | |||
15:30-15:45 | 茶歇 | ||
15:45-18:00 | 疾病相關(guān)基因的查找及獲得 | 用數(shù)據(jù)庫查詢疾病相關(guān)基因 | |
分析GEO數(shù)據(jù)庫中的基因芯片數(shù)據(jù)，獲取疾病相關(guān)基因 | |||
18:00-19:30 | 晚餐 | ||
第一天晚上 | 19:30-20:40 | 基于AutoDock Vina軟件分子對接 | 軟件安裝 |
下載小分子配體和蛋白受體的結(jié)構(gòu)文件 | |||
準(zhǔn)備配體文件和受體文件 | |||
確定對接區(qū)域（對接盒子） | |||
建立配置文件及分子對接 | |||
分子對接結(jié)果輸出 | |||
20:40-20:50 | 休息 | ||
20:50-22:00 | 網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析結(jié)果的驗證 | 靶標(biāo)驗證 | |
通路驗證 | |||
藥物效果驗證 | |||
第二天上午 | 9:00-10:45 | 網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的實用技能介紹（一） | 基因ID轉(zhuǎn)換 |
用DAVID進(jìn)行GO富集、通路富集、tissue富集、疾病基因富集分析；KEGG、Metascape、MetaboAnalyst 通路分析 | |||
用Connectivity Map分析藥物機(jī)制 | |||
10:30-10:45 | |||
10:45-12:00 | 基因功能相關(guān)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 | ||
基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 | |||
12:00-13:30 | 午餐及午休 | ||
第二天下午 | 13:30-15:30 | 網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的實用技能介紹（二） | 全基因組網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)獲取 |
Cytoscape軟件構(gòu)建和分析網(wǎng)絡(luò)：網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建；基本拓?fù)涮卣饔嬎悖恢匾?jié)點識別；網(wǎng)絡(luò)拓?fù)渲笜?biāo)含義；模塊分解；子網(wǎng)絡(luò)提取；網(wǎng)絡(luò)可視化；數(shù)據(jù)輸入輸出；圖形導(dǎo)出；Cytoscape插件的安裝和使用等 | |||
15:30-15:45 | |||
15:45-16:30 | 藥物影響的子網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建、成分-靶點網(wǎng)絡(luò)、成分-靶點-通路網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 | ||
常用圖形繪制方法介紹 | |||
課程總結(jié)及文獻(xiàn)分析 | |||
網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)課題設(shè)計、論文撰寫、基金申請介紹 | |||
備注：攜帶電腦，方便跟隨老師進(jìn)行軟件操作，上課軟件為Cytoscape。 | |||
另需安裝ZOOM網(wǎng)絡(luò)會議軟件方可進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)會議 | |||
上課時間
時間：4月2日-3日（2天1夜）
地點：線上
課程費用
3200元/人；
課程優(yōu)惠
1.提前報名并付款的，可以預(yù)先拿到學(xué)習(xí)資料；
2. 三人組團(tuán)報名，每人優(yōu)惠100元；
3. 四人組團(tuán)報名，每人優(yōu)惠200元；
4. 五人組團(tuán)報名繳費，額外帶一人免費注冊同價值學(xué)習(xí)班；
5、可額外繳納500元，作為復(fù)聽費用（復(fù)聽同樣的課程）。
咨詢及報名方式
TEL:19166210316
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