熒光成像

報告基因表達，細胞，病毒，細菌等示蹤，蛋白和小分子示蹤

靈敏度高，可以檢測活細胞和死細胞的熒光信號，方便，成本低

相對低空間分辨率，特異性差 熒光染料

生物發光成像

報告基因表達，細胞，病毒，細菌等示蹤

極高的靈敏度，快速，方便，成本低

低空間分辨率，通常是二維成像，作用時間短

PET

報告基因表達，小分子示蹤

高靈敏度，可定量示蹤

需要回旋加速器或發生器，相對低的空間分辨率，輻射傷害，價格貴

SPECT

報告基因表達，小分子示蹤

同時多種分子探針，可同時成像，適用臨床

低空間分辨率，輻射損害

MRI

形態學

極高的空間分辨率，可結合形態學

相對靈敏度低，掃描和后加工時間長，需要大量探針，價格貴

CT

腫瘤學，骨科

骨頭和腫瘤成像，解剖學成像

有限的分子應用，有限的溫和組織分辨，輻射損害

超聲

心血管，神經科學

實時成像，低成本，血管動態成像

有限的空間分辨率，主要用于形態學