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Science Advance發表 | 單細胞測序技術應用于男性不育

Time:2024-04-16
研究揭示了ROSI在胚胎發育過程中會出現重編程缺陷,從而揭示了ROSI胚胎發育效率低下的重要原因,也闡述了,利用小分子化合物A366干預這一重編程缺陷過程能夠顯著提高ROSI胚胎的囊胚發育率和存活率。這項研究找到了提高ROSI胚胎發育效率的新途徑,為ROSI技術的優化提供了新的思路。

研究背景

無精癥是導致男性不育的主要因素,其發病率約為男性總人口的1%。在嚴重無精癥患者的睪丸和附睪內通常無法獲取成熟精子或長形精子細胞,因此這部分患者無法通過體外受精或卵胞漿內單精子注射技術獲得其生物學后代。但在部分無精癥患者的睪丸中尚能觀察到圓形精子細胞,圓形精子是睪丸活檢期間可見的最成熟的單倍體細胞。圓形精子細胞注射(ROSI)是一種將精液或睪丸取出的成熟精子的前體細胞(圓形精子細胞)注入卵子助孕的技術。通過這項技術,可以使沒有成熟精子的男性不育患者也能生育自己的子女。由于ROSI胚胎普遍存在發育效率低下的問題嗎,所以這項技術目前成功率比較低,且沒有在臨床上得到廣泛應用,有必要闡明ROSI胚胎中發育潛力受損的潛在機制,從而為ROSI技術優化提供途徑近日,來自南方醫科大學基礎醫學院的白曉春教授、趙小陽教授等研究團隊在《Science Advance》雜志上發表了相關研究成果。研究揭示了ROSI在胚胎發育過程中會出現重編程缺陷,從而揭示了ROSI胚胎發育效率低下的重要原因,也闡述了,利用小分子化合物A366干預這一重編程缺陷過程能夠顯著提高ROSI胚胎的囊胚發育率和存活率。這項研究找到了提高ROSI胚胎發育效率的新途徑,為ROSI技術的優化提供了新的思路。


研究結果

1. 植入前小鼠ROSI胚胎中轉錄組、染色質可及性和DNA甲基化的概述

本研究中使用早期圓形精子細胞進行胞漿內注射,獲得ROSI胚胎。之后進行單細胞RNA測序(scRNA-seq),結果顯示,圓形精子細胞為RS2期精子細胞,仍處于精子發生的早期階段。隨后證實,ROSI和卵胞漿內單精子注射 (ICSI)胚胎在受精時的發育進程基本上是同步的。ROSI和ICSI的微操作過程相似,只是所使用的單倍體雄性生殖細胞發育階段不同。當胚胎構建在B6D2F1背景上時,也觀察到類似的結果。早期圓形精子細胞不成熟的表觀遺傳學狀態可能使它們在受精時對表觀遺傳重編程具有更強的抵抗力。ROSI和ICSI胚胎的所有活胎及其胎盤的重量都是差別不大的,此外,通過ROSI或ICSI獲得的成年小鼠的體重和繁殖能力也沒有區別,說明ROSI胚胎的發育缺陷處于一個相對狹窄的發育時間窗口內,如果胚胎克服了這一問題,則其后續的發育將相對正常。

多組學測序可以在單細胞分辨率下同時分析基因表達、DNA甲基化和染色質可及性。為了探索ROSI胚胎的表觀遺傳重編程信息,對ROSI胚胎的每個細胞進行單細胞多組學測序。本研究共納入138個ROSI胚胎,90個ICSI胚胎作為對照,以消除胚胎微操作技術本身的影響,覆蓋發育的6個關鍵階段,以及包括精子、圓形精子細胞和中期卵母細胞在內的配子。結果顯示,在ROSI胚胎著床前發育期間,DNA甲基化和染色質可及性的重編程均有所提示,但與ICSI胚胎相比仍表現出一定的變化,特別是在原核階段。


2.ROSI胚胎中母體向受精卵過渡相關基因的錯誤表達

如前所述,ROSI胚胎在受精后原核階段發生的表觀遺傳重編程與ICSI對照相比有所不同;特別是ROSI胚胎的雄性原核階段具有獨特的表觀遺傳特征。ROSI胚胎存在母體到受精卵過渡相關基因的錯誤表達,并表現出染色質/細胞骨架組織缺陷。qPCR 結果提示,在ROSI胚胎中被下調的少量ZGA基因在染色質和細胞骨架組織過程中富集,這表明少量ZGA基因的錯誤表達可能與染色質/細胞骨架組織缺陷有關。之后對ICSI和ROSI胚胎的原核形態進行分析。結果提示,ROSI胚胎的雄性原核平均直徑明顯小于ICSI對照組,且該表型維持到PN5期。此外,在ROSI胚胎出現沉積,該沉積與多個染色質特征密切相關。

3.A366可提高ROSI胚胎的發育能力

基于單細胞多組學測序分析和實驗數據,ROSI胚胎的重編程缺陷主要發生在原核期,表現為轉錄組和表觀遺傳修飾的改變。為了探索是否有此前未確定的小化合物可以通過靶向特定的表觀遺傳修飾來提高ROSI胚胎的發育潛力。作者篩選了一個由178個小化合物組成的文庫,這些化合物針對表觀遺傳修飾,包括DNA甲基化和組蛋白修飾?;赗OSI胚胎的發育潛力,從三個方面評估了這些小化合物的最終效果:(i)對早期胚胎無毒,(ii)提高囊胚發育率,(iii)提高活產率。為了證實異常H3K9me2沉積和Ehmt2過度表達會帶來那些表型,作者分析了敲低或過表達Ehmt2后ROSI胚胎的發育能力,結果提示,敲低Ehmt2可顯著提高ROSI胚胎的囊胚率,相反,當Ehmt2過表達時,H3K9me2沉積增加ROSI胚胎囊胚率呈劑量依賴性下降。然而,Ehmt2過表達組同時使用A366對胚胎進行處理,則無法消除Ehmt2過表達對胚胎發育造成的阻滯。A366處理ROSI胚胎可使活產率提高約兩倍。值得注意的是,經A366處理的ROSI胚胎的存活子代健康且可育。此外,經A366處理的體內受精卵的活產率與對照組相當,表明A366處理的安全性??傊?,A366處理能顯著提高小鼠ROSI胚胎的發育水平。


4.A366可以部分克服早期圓形精子細胞產生的ROSI胚胎的重編程缺陷

為了探索A366如何改善ROSI胚胎的發育潛力,對經A366處理的ROSI胚胎進行了單細胞多組學測序。對照組為未處理的ROSI胚胎和ICSI胚胎。根據基因表達譜對聚類細胞進行降維分析。發現ROSI和ICSI胚胎可以被分離成兩個獨立的細胞簇,說明這兩種胚胎的轉錄組在PN5期已經表現出一定的差異。值得注意的是,A366處理可以改變ROSI胚胎的全局基因表達模式。然后使用DNA甲基化和染色質可及性數據進行細胞聚類。與轉錄組數據一致,A366處理的ROSI胚胎從男性和女性原核階段都恢復到獨立的細胞狀態。這些數據與A366可以影響ROSI胚胎發育潛力的發現一致。

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總結 

該研究成果首次系統解析了小鼠ROSI胚胎原核時期的重編程缺陷,并且進一步發現G9A介導的H3K9me2修飾異常是ROSI胚胎發育效率低下的重要原因,而小分子化合物A366在這一過程能夠顯著提高ROSI胚胎的囊胚發育率和活產率。這項研究找到了提高ROSI胚胎發育效率的新途徑,為ROSI技術的優化提供了新的思路。

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